Flavanoli u čokoladi odlični su za mozak. Studija objavljena u časopisu Scientific Reports u novembru 2020. otkrila je da su zdrave odrasle osobe koje su konzumirale kakao bogat flavanolima bile efikasnije u rješavanju problema od onih koji nisu jeli kakao. U prosjeku su bili brži od ostalih za 11%.
Neki stručnjaci kažu da postoji veza između čokolade i prevencije Alzheimerove i Parkinsonove bolesti. Flavanoli mogu zaštititi od oksidativnog stresa i drugih oštećenja ćelija, čuvajući kognitivne sposobnosti starijih osoba. Istraživači su u Britanskom časopisu za kliničku farmakologiju napisali da treba provesti više studija o čokoladi jer su vrste proučavanih flavanola gotovo uvijek one u voću, povrću i čaju.
Čokolada također sadrži protuupalne biljne spojeve koji mogu biti odbrana od upale koja dovodi do bolesti mozga.